وقد أفرد الإمام الترمذي-رحمه الله أبواباً في جامعِهِ في المناقب،أبواباً عديدة في ذِكرِ فضائل آل البيت عليهم السلام،منها:
- باب مناقب علي بن أبي طالب رضي الله عنه،ولهُ كُنيَتان أبو تراب وأبو الحسن
- باب قول الأنصار:كُنا نعرف المُنافقين ببغضهم علي بن أبي طالب وغيرها من الأبواب الكثيرة في ذِكرِ فضائل علي عليه السلام.
- باب مناقب أبي الفضل عُمُ النبي ﷺ وهو العباس بن عبدالمُطلب رضي الله عنه
- باب مناقب جعفر بن أبي طالب رضي الله عنه
- باب مناقب أبي محمد الحسن بن علي بن أبي طالب والحسين بن علي بن أبي طالب رضي الله عنهما
- باب ((إن إبني هذا سيد)) أي الحسن عليه السلام.
- وأبواب عديدة في ذِكرِ فضائل سبطي النبي ﷺ سيدا شباب أهل الجنة الحسن والحُسين عليهما السلام
- باب فضائل أهل بيت النبي ﷺ
- باب ما جاء في فضل فاطمة رضي الله عنها
- باب فضل عائشة رضي الله عنها
- باب فضل أزواج النبي ﷺ
وغيرها من الأبواب